Primer
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Ein Primer (Plural ebenfalls "Primer") ist ein Oligonukleotid, also ein sehr kurzes DNA- oder RNA-Stück. Primer werden von DNA-replizierenden Enzymen wie der DNA-Polymerase als Startpunkt benötigt. Sie sind kurz genug, um sich spontan an einen vorhandenen komplementären DNA-Strang anzulagern, und ermöglichen damit erst die Replikation.
Auch bei der In vitro- DNA-Amplifikation von DNA, beispielsweise bei der Polymerase-Kettenreaktion (PCR), werden Primer benötigt. Hier lässt sich mit Hilfe der Primer der spezifische DNA-Abschnitt, der amplifiziert werden soll, festlegen. Für die PCR werden Primer deshalb immer als Paare ausgewählt, einer für den 5'-Strang und einer für den 3'-Strang, also einen für den codogenen und einen für den nicht codogenen Strang. Der dazwischenliegende Abschnitt wird dann amplifiziert.
Die Primer werden, wenn sie ausgewählt wurden, eigens für eine PCR aus den Bausteinen (den Nucleotiden) hergestellt (synthetisiert). In der Regel werden sie bei Firmen bestellt, die sie innerhalb von wenigen Tagen synthetisieren und liefern können.
Auch für die Reaktion bei der DNA-Sequenzierung wird als Startpunkt für die Polymerase ein Primer benötigt.
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